被交通部長毛治國定調的「蘇花改」（蘇花公路改善計畫）則僅編列三千萬元，綠黨秘書長潘翰聲表示，蘇花改只有規劃費用沒有實質興建經費，蘇花高環評被駁回卻編列實質的經費，這根本是披著羊皮的狼，羊皮是蘇花改狼是蘇花高，劉兆玄院長說一套，做一套完全在欺騙社會。

根據政府編列預算書「交通作業基金」，民國95年至98年未見蘇花高，但99至103年後編列930億元，其中交通作業基金(國道基金)支出 71億元，另外，國庫必須再撥204億，並以發行654億乙纇公債的方式，來彌補原先支出的不足。潘翰聲痛批：「這樣是債留子孫，完全不顧目前每人平均52萬的負債。」

此外，可以立即改善東部交通的「台鐵東線購置計畫」（含區間車154輛及城際客車180輛），在民國98年未編列預算，99年卻暴增100億。潘翰聲也質疑，如此即興式、跳耀式的預算編列方式，若明年沒編列預算，怎麼保證後年花蓮人有車可以坐，如此一來「花東地區幸福工程」即將跳票。

「 花東地區幸福工程」指十年內完成鐵路電氣化擴增載客輛、購72輛太魯閣號及750輛砂石運輸車廂、闢砂石專用車道、改善危險蘇花公路路段；馬英九去年10月也表示，無論蘇花高環評差異結果如何，花蓮地區其他建設仍要改善。

如此編列預算，嗅到新政府陷花東人於不仁，陷環保團體於不義。不仁者，可以立即解決的方案不執行，花東人得繼續站火車三年；不義者，企圖延長交通黑暗期，給民代機會製造興建蘇花高輿論，扣環保團體反地方生存的大帽子。