石門水庫水質是否符合安全指數，引發關切。經濟部長陳瑞隆表示，水庫表面水ｐｈ值確有偏高情形，但實際取水口在表面層五十公尺以下，ｐｈ值七．五到八之間，沒有問題。根據龍潭、平鎮、板新、石門淨水廠檢驗，送到民眾家中的水ｐｈ值在七．二到七．七之間，符合國際標準。

至於環保團體質疑資料有竄改之嫌，水利署北區水資源局局長賴伯勳解釋，偏鹼的ｐｈ值是水資局舊系統監測表面水酸鹼值的數據，水資局新系統增加多處監測點、監測位置也改為水面下十公尺，更符合實際供水狀況。為避免混淆，水資局已停用舊系統。

除了石門水庫，本島還有二十三個水庫，夏季普遍有水質偏鹼性的問題。根據經濟部水利署九十四年度年報資料，二十四個水庫中，一年各時段中，表面水ｐｈ值最高曾超過九的有鯉魚潭水庫、永和山水庫兩個，超過八．五的有十一個。

經濟部水利署署長陳伸賢表示，根據過去經驗，夏天水庫表面水ｐｈ值較高是季節性因素，超過八的機率很高。他分析，夏季溫度高，藻類光合作用旺盛，會使水優氧化，石門水庫十公尺以內的表層水ｐｈ值接近九，的確偏鹼性，但晚上以後會恢復正常。而且水送到淨水廠後會再檢測並處理，送到民眾家裡的飲用水「絕對安全，可以放心。」

環保署環境監測及資訊處副處長朱雨其昨天表示，環保團體與水利署監對石門水庫ｐｈ值檢測不同，可能與取樣地點、時間與氣候等因素有關。該署進行水質監測十多年，迄今未發現異常，各水庫水質都可供自來水廠使用。