勞動部於今日（3月12日）正式公告九月起住院醫師將納入勞基法，本會欣見政府單位重視醫師勞動權益，逐步以法規保障醫師工時。對於現在衛福部、勞動部所並進的「雙軌制」：私立醫院住院醫師屬《勞基法》保障、其他醫師預計以《醫療法》保障，本會有一項聲明、兩項擔憂如下：
部分住院醫師納入勞基法，不致損及病人權益。
許多媒體報導，若住院醫師工時設下上限，恐怕影響病人就醫權。實際上，衛福部早已推動「住院醫師80工時」多年，亦即包含值班時數在內，每四週工時不得超過320小時。過去幾年來，醫院為了符合評鑑規範，透過排班調整、聘請輔助人力等方式，泰半能符合工時規範，未來若納入勞基法84-1條「議定工時」的原則，參照「80工時」標準，人力應不會有太大波動。
未來納入勞基法以後，超過正常工時則必須由醫院給付醫師加班費，所增加成本應屬醫院所能負擔。若醫院為求減少加班費支出，力行落實交班、排班制度改善、減少非必要行政文書作業，讓住院醫師皆能準時下班，隔日養足精神繼續病人照護工作，應屬醫病雙方之福。
擔憂一：公立醫院住院醫師，完全不受法令保障
台大、北榮、成大醫院等公立大型教學醫院，收訓全台灣將近4成的住院醫師，但勞動部卻將公立醫院的住院醫師排除在勞基法之外；衛福部醫事司主導的《醫療法》，同時也將公立醫院住院醫師排除，造成公立醫院住院醫師真正淪為權益孤兒。
雖然勞動部宣稱公立醫院住院醫師已有公務人員法令保障，但實際上沒有工時上限、領不到加班費、與醫院簽訂的契約不受法令約束。未來「一國兩制」的情形成真，恐怕造成公立醫院勞動條件更形低落，負擔重要醫療責任的醫學中心竟成權益死角。
擔憂二：勞動部牛步，各教學醫院無所適從
據工會掌握，許多教學醫院已開始試行打卡制度，為適用勞基法做準備。勞基法84-1條需要勞動部制定新的工時上限，以作為醫院與醫師簽訂契約的基準，但勞動部除了在去年11月與今年3月各發出一次新聞稿預告以外，迄今沒有透露工時上限數字、加班費如何計算等技術細節，醫院管理者紛紛抱怨無所適從。
過去政府屢次修正勞基法，本意是要減少加班以改善過勞，卻因為溝通不及、法制紊亂，勞資雙方都有怨言。我們期待政府在醫師納入勞基法的議題上，更盡責向民間說明，輔導醫院遵法並向住院醫師說明勞基法的益處，以免挽救過勞的美意竟成為混亂的根源。