苛扣菲傭薪資　陳其邁：劉姍姍涉嫌貪汙

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陳哲男涉及的司法案件
梁柏薰司法黃牛案
2002年，梁柏薰涉及華僑銀行超貸案、新偕中建設偽造文書案，為了免除官司，透過新瑞都股東蘇惠珍找上總統府副秘書長陳哲男，並先後交付總計新台幣六百萬的支票予陳，結果仍被判刑，梁柏薰逃往中國。2004年總統選舉期間，梁柏薰指控陳哲男收取不法政治獻金，假借要幫他擺平官司，卻不辦事，台北地檢署開始偵辦。2006年梁柏薰回國投案，檢方將陳哲男依貪污罪嫌起訴[10][11]。
2006年12月13日，台北地院依貪污治罪條例中利用職務詐欺罪，一審判決陳哲男12年徒刑、褫奪公權10年，當晚陳哲男發表聲明，認為此案所涉款項為政治獻金，並無不法，將提起上訴[12]。
2008年6月26日，高等法院考量陳哲男已退回六百萬元，依貪污治罪條例「利用職務上機會詐取財物」罪，改判他徒刑九年、褫奪公權六年[13]。
2010年7月27日，高等法院合議庭認為陳哲男並沒有審理司法案件的權限，因此撤銷原先涉及貪污罪九年刑期的判決，改依詐欺取財罪名，改判他七個月有期徒刑。

高雄捷運外勞弊案
2007年8月24日，高雄地院一審宣判，以罪證不足判陳哲男無罪 [14]。高雄高分檢上訴。
2009年1月15日，高雄高分院認為，無證據證明陳哲男協助華磐取得泰勞管理合約，二審宣判陳哲男無罪[15] [16] 。
2009年2月24日，檢方認為判決沒有違背法令，所以不向法院提起上訴，陳哲男無罪確定[17] [18] [19] 。

陳由豪政治獻金案

被監察院彈劾
2008年11月14日監察院召開審查會以10票對2票通過彈劾陳哲男，並送交公務員懲戒委員會。主查監委周陽山表示，彈劾陳哲男三項理由，第一，接受高捷外勞仲介業者招待，未經請假擅自出國，並與前高雄捷運副董事長陳敏賢涉足賭場等不當場所；在國策顧問任內，也未經報備，兩度赴越南旅遊；第二，指派總統府會計處專員高慎慎在上班時間為他處理私人財務並買賣股票；第三，利用他人帳戶買賣股票，未依法辦理財產申報，顯已違反公務員服務法的規定，所以依法提案彈劾。周陽山再指出，可惜陳哲男退休金已一次領完，即使被彈劾，一毛都討不回來。