內政部於今年9月初上網公告「全國區域計畫草案」，原本未規畫任何公聽會，經環保團體9月14日到內政部抗議後才願意召開四場公聽會，今天台南場為最後一場公聽會，針對內政部表達四場公聽會完就要公告「全國區域計畫」，環團嚴厲反對，要求內政部【全國區域計畫草案】依法應提送環保署進行政策環評。依據92年「環境影響評估法」第26條及「政府政策環境影響評估作業辦法」相關規定，有影響環境之虞之政府政策，應實施環境影響評估，且政策研提機關於政策報請行政院核定時，應檢附評估說明書。今天有南部多個團體出席，包括台南市環境保護聯盟、台南市社區大學研究發展學會、台南市水資源保育聯盟、台灣水資源保育聯盟、屏東環保聯盟、屏東縣教育產業工會生態中心、 屏東縣教師會生態教育中心、高雄綠色協會、南方水盟、社團法人台南市野鳥學會、高雄市大崗山人文協會、社團法人台灣濕地保護聯盟、大台南野鳥學會及七股海岸保護協會等。
台南市環境保聯盟理事長邱雅婷表示，「全國區域計畫草案」存在諸多爭議，包括要鬆綁農地、山坡地及水庫集水區等非都市土地之開發，台南市目前正規劃「烏山頭水庫」水庫集水區"六甲活動斷層"以西為"都市計畫區"」，可能「全國區域計畫」一正式公告就可宣布，但是，此都市計畫應再做"政策環評"，因為會影響烏山頭水庫水質、水體安全，因為六甲活動斷層帶以西的地下水會往東流，流入烏山頭水庫，而台南市政府尚未公告六甲活動斷層帶二側一定距離，如此區開發，對烏山頭水庫影響很大，此區如要進行都市計畫，賴清德市長應做政策環評。
台南市水資源保育聯盟理事長黃安調表示，「全國區域計畫草案」鬆綁可開發十公頃以下的「鄉村型小型園區」，免做環評，也可依產業創新條例變更為「工業區」，如此一來是否將導致鄰近農地之土壤及灌溉用水，甚至地下水將受到汙染? 萬萬不可。又今年康芮及天兔等颱風也對南台灣造成嚴重災情，包括賴清德、陳菊及張花冠等縣市長也要求中央應繼續補助數百億治水預算，可見水庫集水區的崩塌淤積情況仍未改善，故內政部未提出有效管理策略與評估方案，實在不應該進行水源區開發，請監察委員調查此計畫有破壞水資源及圖利財團嫌疑。
台南市社區大學研究發展學會吳仁邦專員表示，102年修正版「全國區域計畫草案」規劃八成以上的水庫集水區都可興建旅館休憩遊樂等開發，將嚴重惡化水庫淤積及水庫攔河堰水質，影響飲用水安全，而且一旦通過，非都市土地開發管制規則及相關審議規範命令都將配合修訂，廢棄物填海造陸政策也將有法定計畫依據，未來推動將更容易，而於全國78%水庫集水區山坡地放行開發後，水源區崩塌更嚴重及水庫瀕臨死亡之日將不遠了，國家安全何在?故要求【全國區域計畫草案】依法應送環保署進行政策環評。
屏東縣教師會生態教育中心朱玉璽表示，全國區域計畫草案刪除沿海自然保護區禁止任何改變現有生態特色及自然景觀拿掉海岸禁止變更，美麗灣、悠活案違法案也可解套；悠活飯店14年違法營運破壞海洋生態政府不追究，再補做環評即將就地合法，政府帶頭鼓勵違法，實在惡劣。
屏東環保聯盟執行秘書陳玲瑤表示，全國區域計畫草案刪除活動斷層兩側限制開發，未來核三廠政府就可以再擴大機組，核四廠開發也可解套；另外，當縣市政府又不願公告活動斷層兩側一定距離時，包括民眾買房子只好戰戰兢兢，因為沒有政府單位與建商會負責。
台南市水資源保育聯盟理事邱春華表示，全國區域計畫草案更將鬆綁審查及變更機制，又規劃非法開發可合法化機制，此無異鼓勵非法。而包括農地及非都市土地之開發變更劃定將更寬鬆；又修訂地方政府可規劃工業區、風景區、新市鎮與舊市鎮等開發，一旦通過，細部設計不必再審議，更將可能流於黑箱作業；而鼓勵地方政府可圈地規劃開發並鬆綁其開發程序，金權政治將更囂張了?!
環保團體一致表示，憲法賦予人民生命財產應受保障，而內政部訂定全國區域計畫與農委會提出水保法修法前都未召開行政聽證會，未依法進行政策環評，要求內政部依法不得公告。